神经外六科前身为广东三九脑科医院建院之初就成立的功能神经外科。科室在国内诸多知名神经外科专家如谭启富教授、李龄教授、吴若秋教授的指导下，及医院院长朱丹、科室主任吴杰的努力下，经过20多年的发展，已经成为具有鲜明专业特色的以微侵袭及精准神经外科技术为手段的综合神经外科。其在功能神经外科（癫痫、帕金森等运动障碍性疾病的DBS治疗）、神经内镜（垂体瘤、颅底肿瘤及脑室内病变）、功能区肿瘤、出血性及缺血性脑血管病的外科治疗（动脉瘤夹闭术、颈动脉内膜剥脱术及血管搭桥术）及昏迷促醒（脊髓电刺激术）上已有近万例的临床手术经验。在继承与发展传统技术优势的同时，科室时刻与国际神经科学技术的发展保持高度接轨，相关专业领先科技在临床得以广泛应用，包括但不限于癫痫外科术前评估的立体定向脑电图（SEEG）电极植入技术、功能神经导航技术、神经内镜技术、术中超声结合神经导航监测技术、术中神经电生理监测技术、术中血管荧光及肿瘤荧光技术、术中唤醒麻醉技术等。科室在神经调控手术、癫痫外科手术、脑动脉瘤手术、颅底肿瘤及功能区肿瘤手术、缺血性脑血管病手术的微创治疗上有了长足发展，特别是在功能区肿瘤及癫痫病灶切除的语言和运动等功能区保护上，积累了丰富的经验。科室主要业务：神经调控手术：帕金森病等运动障碍性疾病的DBS治疗；三叉神经痛及面肌痉挛的微血管减压术；（脑出血、脑外伤等各种原因导致）慢性意识障碍（植物人、微小意识障碍）的促醒治疗。癫痫外科手术：各类顽固性癫痫的术前评估（颅内立体定向电极植入（SEEG）及硬膜下电极植入、常规视频脑电监测、脑磁图、WADA实验等）；各类癫痫病灶切除术；深部电极射频毁损手术、VNS（迷走神经刺激术）及DBS（脑深部电刺激术）等。神经内镜手术：垂体瘤、脊索瘤、颅咽管瘤、脑膜瘤等颅底肿瘤切除；脑积水及脑室内病变的脑室镜治疗，如三脑室底、透明隔造瘘、中脑导水管扩张、脑室内肿瘤活检等。脑血管病手术：脑动脉瘤夹闭术及介入栓塞；缺血性脑血管病变治疗，如颈动脉内膜剥脱术、烟雾病血管搭桥术；脑动静脉畸形综合治疗；脑出血的综合治疗等。脑肿瘤手术：颅底肿瘤（鞍区颅咽管瘤、脑膜瘤、垂体瘤、胶质瘤；桥小脑区肿瘤、岩斜区肿瘤、枕大孔区肿瘤及松果体区肿瘤）；各类功能区肿瘤（胶质瘤、转移瘤、脑膜瘤等）。颅脑损伤手术：各种危重颅脑损伤的手术治疗及康复治疗。